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 çàâèñèìîñòè îò ìåñòà ðàñïîëîæåíèÿ âûäåëÿþò àðàõíîèäàëüíóþ è âíóòðèìîçãîâóþ (öåðåáðàëüíóþ) êèñòó. Ïåðâàÿ ëîêàëèçóåòñÿ â ìîçãîâûõ îáîëî÷êàõ è îáðàçóåòñÿ çà ñ÷åò ñêîïëåíèÿ öåðåáðîñïèíàëüíîé æèäêîñòè â ìåñòàõ èõ âðîæäåííîé äóïëèêàòóðû èëè ñïàåê, ñôîðìèðîâàâøèõñÿ â ðåçóëüòàòå ðàçëè÷íûõ âîñïàëèòåëüíûõ ïðîöåññîâ. Âòîðàÿ ðàñïîëàãàåòñÿ âî âíóòðåííèõ ñòðóêòóðàõ ãîëîâíîãî ìîçãà è ôîðìèðóåòñÿ íà ó÷àñòêå ïîãèáøåé â ðåçóëüòàòå ðàçëè÷íûõ ïàòîëîãè÷åñêèõ ïðîöåññîâ ìîçãîâîé òêàíè. Îòäåëüíî âûäåëÿþò òàêæå êèñòó øèøêîâèäíîé æåëåçû, êèñòó ñîñóäèñòîãî ñïëåòåíèÿ, êîëëîèäíóþ è äåðìîèäíóþ êèñòû.
Âñå ìîçãîâûå êèñòû ïî ñâîåìó ãåíåçó êëàññèôèöèðóþòñÿ íà âðîæäåííûå è ïðèîáðåòåííûå. Ê èñêëþ÷èòåëüíî âðîæäåííûì îòíîñÿòñÿ äåðìîèäíàÿ è êîëëîèäíàÿ êèñòà ãîëîâíîãî ìîçãà.  ñîîòâåòñòâèè ñ ýòèîëîãèåé ñðåäè ïðèîáðåòåííûõ êèñò ðàçëè÷àþò ïîñòòðàâìàòè÷åñêèå, ïîñòèíôåêöèîííûå, ýõèíîêîêêîâûå, ïîñòèíñóëüòíûå.
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 ñîîòâåòñòâèè ñ ýòèîëîãèåé ñðåäè ïðèîáðåòåííûõ êèñò ðàçëè÷àþò ïîñòòðàâìàòè÷åñêèå, ïîñòèíôåêöèîííûå, ýõèíîêîêêîâûå, ïîñòèíñóëüòíûå.
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